Monsignor Tommaso Caputo è nato il 17 ottobre 1950 ad Afragola, provincia e arcidiocesi di Napoli. È stato alunno del Seminario Arcivescovile partenopeo e ha conseguito la licenza in Teologia presso la Pontificia Facoltà Teologica dell’Italia Meridionale.

Ordinato presbitero il 10 aprile 1974, dopo due anni di ministero come vice parroco a San Benedetto all’Arco Mirelli in Napoli, è stato destinato alla Pontificia Accademia Ecclesiastica, frequentando al contempo i corsi di Diritto Canonico presso la Pontificia Università Lateranense e conseguendo il dottorato. Conosce il francese, l’inglese e lo spagnolo.

Dal 25 marzo 1980 ha ricoperto incarichi al servizio della Santa Sede nelle Nunziature Apostoliche in Ruanda (1980-84), nelle Filippine (1984-87) e in Venezuela (1987-89). Chiamato in Segreteria di Stato nel 1989, ha svolto servizio presso la segreteria del Sostituto fino al 19 giugno 1993, quando San Giovanni Paolo II lo ha designato Capo del Protocollo.

Il 3 settembre 2007 è stato nominato Nunzio Apostolico in Malta e in Libia ed elevato alla dignità arcivescovile da Benedetto XVI; da cui ha poi ricevuto, il 29 settembre, l’ordinazione episcopale nella Basilica di San Pietro.

Il 10 novembre 2012 Benedetto XVI lo ha nominato Arcivescovo Prelato di Pompei e Delegato Pontificio per il Santuario della Beata Maria Vergine del Santo Rosario.
Il 21 novembre successivo ha preso possesso canonico, mentre la celebrazione solenne di inizio del ministero pastorale nella Città Mariana ha avuto luogo il 12 gennaio 2013.

Attualmente è anche Presidente del Collegio dei Revisori dei Conti della CEI, nonché delegato per l’Osservatorio Giuridico e referente per i Santuari nella Conferenza Episcopale Campana. Dal settembre 2019, con l’approvazione di Papa Francesco, è Assessore dell’Ordine Equestre del Santo Sepolcro di Gerusalemme.